I compiti istituzionali affidati al Comando Provinciale Vigili del Fuoco di Varese consistono prevalentemente nell'azione di soccorso tecnico urgente e nell'attività di prevenzione incendi (Legge 23/05/1961 n° 469).
Il Comando è articolato in una sede Centrale, dove oltre all'attività operativa viene svolta tutta l'attività amministrativa, ed in 5 distaccamenti e un nucleo elicotteri distribuiti sul territorio della provincia nei quali viene svolta solo attività operativa di interventi di soccorso tecnico urgente.
Presso il distaccamento aeroportuale di Malpensa, dal 1° giugno 1994, è operativo il nucleo elicotteri della regione Lombardia coordinato dall'Ispettorato regionale vigili del fuoco per la Lombardia.